Отряд "Черепахи" делят обычно на 2 или 3 подотряда по типу втягивания головы. К ним относятся:
Подотряд Amphichelydia (вымершие)
- голова не втягивалась. К нему относятся Triassochelys, Proganochelys, Proterochelys...
Господствующее положение среди меловых черепах занимали Baenoidea — прогрессивные амфихелидии, сменившие плевростернид. Уплощенность панциря многих из них, удлиненные подпорки и тому подобные признаки указывают на их преимущественно водный образ жизни. Некоторые из них удивительно наг поминают Toxochelyidae — примитивных мор» ских черепах в. мела и палеоцена — эоцена. Но были среди Baenoidea и наземные черепахи необычайного облика, с рогообразными выростами на черепе и костным «воротником», напоминающим воротник рогатых динозавров. Это — Meiolaniidae — группа, дожившая в Австралии до плейстоцена, когда все остальные амфихелидии уже давно вымерли.
Подотряд Cryptodira
- голова втягивается по меридиальной линии или втягивается частично. Речные, морские и сухопутные формы. К нему относятся Thalassemydidae, Eurysternum и современные виды.
В основании типичных скрытошейных черепах, впервые появившихся в раннем мелу, стоят, как предполагают, Dermatemydidae, отмеченные уже в в. юре, но достигшие расцвета лишь в в. мелу и палеоцене — эоцене. Среди дерматемидид известны как формы, более близкие к плевростернидам, так и напоминающие Baenidae или определенно тяготеющие к Chelydridae. Произошли дерматемидиды, видимо, от каких-то плевростернид и широко распространились в С. Америке, Ц. Азии и 3. Европе. Лишь один центрально-американский род Dermatemys дожил до настоящего времени. Возможно, что дерматемидиды дали начало Emydinae — основной прогрессивной группе полуводных и водных черепах. В позднем мелу эмидины были еще очень редки (один род), но уже в эоцене известно около семи родов. Большинство современных черепах также относится к этой группе. В эоцене от каких-то примитивных эмидин произошла единственная группа настоящих наземных черепах — Testudininae, характеризующаяся столбообразными конечностями и очень выпуклым панци-рем. Некоторые из них достигали гигантских размеров; так, известны панцири, достигающие 1,5 м и больше в длину. Некогда гигантские наземные черепахи были широко распространены в Америке, Европе, Азии и Африке, но сейчас они образуют лишь небольшие колонии на Галапагоских, Маскаренских и Сейшельских островах.
Подотряд Pleurodira
- голова втягивается будучи повернута на сторону. Речные формы. К нему относятся Plesichelydae, Miolanidae и современные виды.
В раннем мелу появились и первые бокошейные черепахи, однако, несмотря на широкое распространение в позднем мелу и палеогене (Ю. и С. Америка, 3. Европа и Африка), они, по-видимому всегда занимали подчиненное положение, может быть, в связи с их узкой водной специализацией. Все бокошейные черепахи обитают в пресных водах. Возникнув от плевростернид, более древнее семейство бокошейных черепах — Pelomedusidae — достигло расцвета в позднем мелу и эоцене, сохранившись сейчас лишь в Ю. Америке и на Мадагаскаре. Другое, более молодое семейство — Chelyidae — известно лишь с плиоцена. Современные Chelyidae обитают в Ю. Америке и Австралии.
